Thịt trắng hoặc thịt đen? Phục vụ dữ liệu lớn để giải mã Lễ Tạ ơn

Anonim

Đối với các chuyên ngành hóa sinh của Virginia Tech, Cat Hayes, Duke Nguyen và Will Stone, gà tây đã mang một ý nghĩa hoàn toàn mới.

Ba người, cùng với các bạn cùng lớp hóa sinh của họ, đã bị Richard Helm, một giáo sư tại Khoa Sinh hóa và Khoa học Đời sống thuộc Khoa Nông nghiệp và Khoa học Đời sống, thách thức để xem xét khoa học đằng sau Lễ Tạ Ơn.

Giáo sư đã cho sinh viên của mình cơ hội để thâm nhập vào thử nghiệm bằng cách phân tích các tập dữ liệu lớn và dành thời gian trong phòng thí nghiệm với các công cụ hiện đại. Lấy HokieBird làm nguồn cảm hứng, các sinh viên đã tiến hành phân tích protein về gà tây, nhìn vào chân, đùi và thịt vú. Họ được yêu cầu điều tra sự khác biệt giữa thịt trắng và thịt đen bằng cách phân tích các protein cung cấp cho gà tây màu sắc của nó.

"Bạn có thể chìm rất nhiều thời gian vào bộ dữ liệu", Helm nói. "Bạn có thể nhận được nhiều câu hỏi hơn là câu trả lời. Nhưng đây là điều mà nhiều sinh viên không bị thách thức. Tôi muốn họ kiểm tra dữ liệu thực tế từ một thử nghiệm thực sự nơi họ có ảnh đầu tiên trong phân tích."

Các sinh viên xem xét các protein thiết yếu nhất, khám phá các nhận dạng protein chất lượng cao. Họ cũng đã học được cách xác định các chất gây ô nhiễm trong các mẫu gà tây để xem làm sạch mô như thế nào. Để hiểu được sự khác biệt về số lượng giữa các protein mô vú, đùi và chân mô, các sinh viên đã phân tích các bảng tính với hàng nghìn lĩnh vực - một nhiệm vụ khó khăn. Sau đó, họ đã phát triển công thức, mã hóa màu, bộ lọc và các phương pháp khác để cho phép họ thấy sự khác biệt và đánh giá ý nghĩa thống kê.

"Tôi đã rất sợ hãi và hào hứng", Stone, một học sinh từ Springfield, Virginia nói. "Sau khi nhìn chằm chằm vào dữ liệu trên máy tính của tôi trong ít nhất một giờ, tôi chỉ nhảy xuống nước để tìm ra cách sắp xếp tất cả."

Nguyễn cũng sử dụng một tấm bảng để vẽ ra thông tin, cùng với sơ đồ Venn.

Những người thử nghiệm gà tây cũng có thể nhận được một số trợ giúp công nghệ cao từ một máy đo phổ khối kết hợp với một thiết bị sắc ký lỏng. Thiết bị mới được mua lại này có thể tiến hành các xét nghiệm tinh vi, cho thấy các nhà điều tra trẻ tuổi có sự phong phú tương đối của các protein gà tây khác nhau. Mặc dù các thành viên của Phòng thí nghiệm Helm vận hành máy, các sinh viên đã có thể học cách đọc dữ liệu do dụng cụ cung cấp. Máy cũng giúp họ xác nhận kết quả của họ.

Các nhà nghiên cứu phát hiện ra rằng các enzym tham gia vào quá trình glycolysis, con đường trao đổi chất chuyển hóa glucose thành năng lượng, tương tự như ở đùi gà và chân, và khác nhau ở vú. Nồng độ của các protein glycolysis trong vú cao hơn vì cơ này được sử dụng để bay trong chim, một quá trình dựa chủ yếu vào quá trình glycolysis.

Thịt đùi và chân có chứa ít glycolysis protein và nhiều protein kết hợp với ti thể bởi vì các mô này nhận được lượng oxy cao hơn, và những cơ này được sử dụng thường xuyên hơn khi gà tây đang đứng hoặc di chuyển.

Mặc dù tập trung vào protein, các sinh viên cũng phân tích chất béo trong ba mô gà tây và thấy rằng chất béo thịt đùi bị oxy hóa nhanh hơn thịt bò hoặc thịt chân. Điều này, theo Helm, có thể thúc đẩy nghiên cứu gà tây hơn so với đông lạnh so với tươi, hoang dã so với trong nước, hữu cơ so với truyền thống, và vv.

Hayes, một học sinh đến từ Plainfield, Illinois, nói: "Thật là vui." Cả ba sinh viên đều biết rằng họ có thể chinh phục các bộ dữ liệu đáng sợ cũng như áp dụng kiến ​​thức sinh hóa của họ vào dữ liệu thực. Họ cũng háo hức muốn xem nghiên cứu nào khác có thể được lấy cảm hứng từ công việc của họ.

Chỉ trong thời gian cho Lễ Tạ Ơn, một tập hợp các phát hiện của học sinh sẽ được xuất bản trong BioRxiv, một dịch vụ lưu trữ và phân phối trực tuyến miễn phí cho các bản in sẵn chưa được xuất bản trong khoa học đời sống.

menu
menu